pH值可以改變水的化學成分，導致水質發生質的變化。 對于魚類的日常生活來說，當pH值較高時，水的化學成分會穩定發展，當pH值稍低時，水的化學成分就會形成惡性循環。pH值稍低，土壤有機質溶解緩慢且不充分，釋放出許多有害物質，其中主要有CH4、CO2和H2S，可破壞水體，部分氣體如H2S 可以立即傷害魚。由于有機物酸化速度減慢，固氮菌的生物活性降低，魚餌生物無法繁殖，水體越來越差。在酸性水中，一些化學物質的有機化學形態會發生變化，例如，對金屬離子的吸附能力會變弱，甚至被吸附的離子會被解吸，從而增加水中的懸浮物。分離出的重金屬離子毒性加重，可侵入生物活性物質的生命力遺傳基因，破壞生物體的酸性系統軟件，使生物體無法生存，長此以往，生物感受積毒身亡。生產實踐證明，如果將pH值提高到中性或微堿性，則極有可能降低甚至消除這種毒性。 例如，汞可以從塑料中的一甲基汞有害物質轉化為二甲基汞，二甲基汞可以自由蒸發和釋放； 鉛可以通過一些替代的生物吸附來沉積； 銅也可轉化為堿式硫酸銅有毒沉積物。 這種積累的金屬材料毒性大大降低。 還有一些有毒氣體也被轉化了，比如H2S，它是有毒的，當PH值升高時變成HS-或S-無毒性的形狀存有；NH3是有毒的，當pH值升高時會變成NH4的形狀，失去毒性； 雖然 CO2 是有毒的，但當 pH 值升高時，其毒性會顯著降低。 尤其是由于上述因素的變化，立即引起溶氧量的調整。 一般來說，溶解氧與pH值呈正相關并波動。

水中的營養物質也會受到 pH 值的影響。 例如，當磷在pH值6.5~8.5中間時，聚磷酸鹽類因化學沉淀或吸附固定作用的破壞相對較小。另一個例子是高錳酸鹽指數，當pH值在7~11的中間時，毒性相對較低。總而言之，我們需要適度控制pH值，這樣水質中的化學成分才能穩定發展。